A coleção Acervo Museológico é constituída por 1040 objetos digitais que se caracterizam por sua natureza arqueológica do período da pré-história brasileira e também pelo período de intervenção colonial na região, do qual é fruto a construção do Recolhimento de Santa Teresa e dos bens móveis a ele associados. Além da vertente arqueológica, o acervo também compreende objetos relativos à cultura pesqueira mais recente.

A tipologia do acervo é, portanto, arqueológica, antropológica e etnográfica.